Raúl Bermúdez Arreola, sobrino de Hernán Bermúdez Requena, fue nombrado responsable de los tramos 4 y 5 del Tren Maya, pero más tarde fue destituido por presuntas irregularidades relacionadas con corrupción.
Si bien, todas las refinerías exceden sus presupuestos iniciales, Dos Bocas encabeza la lista de sobrecostos, superando incluso el promedio mundial de incremento, que se sitúa en 81.8%.
Antes de ser nombrado, Bermúdez ocupaba el cargo de subsecretario de Protección Civil y Readaptación Social, sin embargo, en el 2006 fue detenido por la SIEDO, acusado de tener vínculos con el asesinato del ganadero Ponciano Vázquez Lagunes. No obstante, fue liberado sin enfrentar consecuencias legales.